目的)データソースを探す。
染色体上での遺伝子マップのデータをネットから探す(2008/05/29~2008/06/02)。
===
昨年(2007)、ヒトゲノムのデータマイニングを検討した際、塩基配列をdownloadしたことがあったが(こちらは進展なし?)、改めてデータソースを管理しているサイトを調べなおす。
===
現段階でたどり着いたのが、以下。
最初は、ヒトゲノムの2,3の染色体で遺伝子分布を確認するだけであったが、ヒト以外の種ではどうかということで、対象範囲を広げた。
~~~
[1]米国:有名なNIH
Human Genome Resources (ヒトゲノム)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/human/
~~~
[2]
UCSC Genome Bioinfomatics
http://hgdownload.cse.ucsc.edu/downloads.html
補足)
真核生物比較ゲノムブラウザ
http://www-btls.jst.go.jp/ComparativeGenomics/index_j.html
から入っていって、「UCSC...」にリンクしていった。
~~~
[3]日本:イネの遺伝子
Rice - Oryza sativa GBrowse - Map View Build 04
http://rgp.dna.affrc.go.jp/whoga/download.html
~~~
0 件のコメント:
コメントを投稿